Muzeum powstało w 1984 r. i mieści się w domu, w którym mieszkała rodzina Wojtyłów. Jego obecny wygląd to efekt prac prowadzonych od 2009 r., podczas których całą kamienicę zamieniono na nowoczesne muzeum poświęcone Ojcu Świętemu.

Zwiedzanie rozpoczyna się przy wejściu do budynku od strony wadowickiego rynku. W pierwszym pomieszczeniu przedstawiono dzieciństwo papieża -  zdjęcia jego przyjaciół i nauczycieli; w umieszczonych na środku sali oszklonych gablotach można zobaczyć świadectwa szkolne Karola Wojtyły.  Znajdujące się na piętrze dawne mieszkanie papieża umeblowane jest na wzór tego, w którym mieszkała rodzina Wojtyłów. Zachowało się niewiele oryginalnych przedmiotów- jedynie piec kaflowy, naczynia, półka, torebka należąca do mamy papieża. Kolejne pomieszczenia prezentują etapy życia Jana Pawła II- kolejno: studenta, kapłana, papieża. Podziwiać tam można  jego osobiste pamiątki, listy, rękopisy, strój narciarski, sutanny, zdjęcia. Na zwiedzających ogromne wrażenie robi sala, w której zgromadzono ziemię z kilkunastu państw, które podczas pielgrzymek odwiedził papież oraz sala „Niebo”, w której ściany pokryte są karteczkami z prośbami ludzi z całego świata zostawionymi na grobie Jana Pawła II w Watykanie, które podarowano wadowickiemu Muzeum. Dopełnieniem zwiedzania są opowieści przewodnika oraz wyświetlane filmy z wyboru Karola Wojtyły na papieża, z jego spotkań z młodzieżą i pielgrzymek.

Muzeum Dom Rodzinny Ojca Świętego Jana Pawła II w Wadowicach zostało w pełni przygotowane dla osób poruszających się na wózkach inwalidzkich, którzy bez żadnych barier mogą podziwiać pamiątki po Ojcu Świętym. Nie ma progów, przejścia do sal są szerokie, są podjazdy i winda między piętrami. W obiekcie znajduje się również toaleta przystosowana do potrzeb osób niepełnosprawnych.

Muzeum zwiedza się grupowo w towarzystwie przewodnika. Samochód należy zostawić na parkingu znajdującym się kilkaset metrów za budynkiem, z uwagi na położenie Muzeum w centrum Wadowic. W Muzeum obowiązuje zakaz fotografowania.

Osobie z niepełnosprawnością przysługuje ulgowy bilet wstępu.